Consisteix en el transport de les diàspores per l'aigua. L'aigua té un paper molt discret en la disseminació de les diàspores, encara que és de gran importància per a aquelles plantes que creixen a les vores de rius i altres ambients aigualosos on preferentment són transportades surant.
Fora del nostre territori n'hi ha un exemple molt clar, com és el cas dels cocoters (
Cocos nuccifera),
ja que els cocos són duts d'un territori a un altre transportats pels corrents marins.
No obstant això, l'aigua també actua com a agent indirecte o passiu de disseminació:
- Ombrohidrocòria: les gotes de pluja cauen damunt d'una càpsula seca i amb l'impacte obliguen les llavors a sortir projectades, especialment si són càpsules del tipus pixidi (ex., Amaranthus sp., Anagallis arvensis).
- Nautohidrocòria: les diàspores suren a l'aigua i són arrossegades per l'aigua que s'escola superficialment després de les pluges, o pels grans corrents (ex., Valerianella, Astragalus clusianus).